Assisi città di origine umbra, con l'insediamento divenne municipio romano e prese il nome di Asisium.
La città conquistata dai Goti di Totila nel 545, fece poi parte del Ducato di Spoleto longobardo e franco. Nel 1189, avvalendosi dell'assenza del delegato imperiale, gli abitanti di Assisi assalirono la sua rocca. Dato che Perugia cercò di infiltrarsi nella lotta di liberazione assisana, Assisi andò contro Perugia e fu battuta a Ponte S. Giovanni.
Uno dei tanti prigionieri dei Perugini fu un giovane di nome Giovanni di Bernardone, chiamato Francesco, figlio del ricco commerciante di tessuti Pietro di Bernardone, Dopo che fù prigioniero dei perugini decise di partecipare alla crociata di Gualtiero di Brienne, ma una malattia lo obbligò a fermarsi a Spoleto. Francesco fece un cambiamento nella sua vita, rinunciò alle ricchezze di famiglia e si dedicò ai poveri. Intanto ebbe in dono dai frati Benedettini la cappella di S. Maria degli Angeli, anche nota come la Porziuncola, dove fondò il suo ordine, quello dei Frati Minori. Nel frattempo incontra Chiara, anche lei di Assisi e famiglia nobile e per lei fondò l’ordine delle Clarisse. Nel 1224 ricevette le stimmate,mentre morì a Verna e nel 1126. Due anni più tardi venne fatto santo e si iniziarono subito i lavori per costruire un convento in suo onore. Stessa cosa successe a S. Chiara fu fatta Santa 2 anni dopo la sua morte, nel 1253, e un anno più tardi iniziarono la costruzione della chiesa in suo onore.